業務系システム（ぎょうむけいしすてむ・business system）とは、企業の業務を効率化・自動化するシステムのことです。社内の給与システムや勤怠管理システム、経理システムなどがこれにあたります。つまり、B to B（Business-to-business）のシステムです。
業務システムは企業内の業務に直接的に関わり、あらゆる物事を円滑に進めるためのシステムです。そのため、業務系システムが停止してしまったり、誤作動してしまったりすると、企業全体の業務に支障をきたす可能性があります。
業務系システムの開発には、主にJavaやC++、C#などの言語が用いられます。
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